郭启科（？—？），字令生，四川重庆府铜梁县人，明末清初政治人物。同进士出身。

崇祯三年（1630年）庚午科四川乡试第四名举人，崇祯七年（1634年），登甲戌科会试第一百四十三名，廷试三甲第一百九十四名进士，工部观政，本年八月授山东东昌府推官^[1]。

曾祖郭永禄；祖郭大德，乡饮宾、载府县志；父郭楷，乡饮宾。