林应元（1560年—？），号汉城，锦衣卫籍，顺天府东安县人，明朝政治人物。

万历七年（1578年）己卯科顺天乡试举人，二十年（1591年）壬辰科三甲第三十五名进士^[2][3]。工部观政，选庶吉士，二十四年丁忧归。服阕，二十五年二月除授吏科给事中^[4]，本年巡视皇城，二十六年降为甘肃苑马寺主簿，卒于官。

曾祖林凤；祖父林宏；父林栋^[5]。